Оценка генетического разнообразия внутрипородного типа породы Сарбоянский карп Cyprinus carpio L.
https://doi.org/10.36038/0131-6184-2025-1-110-115
EDN: RREMYT
Аннотация
Представлены результаты оценки генетического разнообразия стада сарбоянской породы карпа, разводимого в рыбоводном хозяйстве «ЭКО-ПАРК» в Мошковском районе Новосибирской области, по результатам генотипирования 14 SSR-локусов. Проведенный микросателлитный анализ показал, что сарбоянская порода карпа обладает высоким внутрипородным генетическим разнообразием. В 14 исследуемых микросателлитных локусах было обнаружено 315 аллелей. Диапазон числа эффективных аллелей (Ne) в локусах колебался от 3,866 до 14,754. Такая широкая вариативность аллелей дает возможность для эффективного проведения генетической паспортизации и идентификации породы сарбоянского карпа. Индекс Шеннона (I) для 14 SSR-локусов имеет значение 2,298, это означает, что изучаемое стадо рыб имеет среднюю сложность структуры. Наименьшее значение ожидаемой гетерозиготности (He) составило 0,741 в локусе Mfw 28, а наибольшее – 0,932 было отмечено в локусе Mfw 1 и 0,920 в локусе Mfw 9. Высокое значение ожидаемой гетерозиготности (Hе) свидетельствует о большой разрешающей способности маркера к локусам Mfw 1 и Mfw 9.
Об авторах
И. В. Морузи
Новосибирский государственный аграрный университет
Россия
Россия
Морузи Ирина Владимировна – доктор биологических наук, профессор, зав. кафедрой биологии, биоресурсов и аквакультуры
630039, г. Новосибирск, ул. Добролюбова, 160
Е. А. Елисеева
Новосибирский государственный аграрный университет
Россия
Россия
Елисеева Елизавета Андреевна – аспирант кафедры биологии, биоресурсов и аквакультуры
630039, г. Новосибирск, ул. Добролюбова, 160
Н. Н. Разоков
Новосибирский государственный аграрный университет
Россия
Россия
Разоков Наимджон Насимджонович – аспирант кафедры биологии, биоресурсов и аквакультуры
630039, г. Новосибирск, ул. Добролюбова, 160
М. С. Михайлова
Новосибирский государственный аграрный университет
Россия
Россия
Михайлова Мария Сергеевна – студент кафедры биологии, биоресурсов и аквакультуры
630039, г. Новосибирск, ул. Добролюбова, 160
Список литературы
1. Серветник Г.Е. Кормление карпа кормами с разным содержанием белка // Время научного прогресса: Сборник научных трудов по материалам IV Международной конференции «Время научного прогресса» 11 апреля 2022 г. – Волгоград: "Научное обозрение". 2022. С. 39-47.
2. Богерук А.К. Генезис и современное состояние пород карпа в России и сопредельных странах // Рыбоводство и рыбное хозяйство. 2008. № 6. С. 21-27
3. Коровин В.А. Методы выведения и современное состояние сарбоянской породы карпа: – Сборник: Селекция рыб. – Москва: ВО Агропромиздат. 1989. С. 195-210.
4. Мюге Н. С., Барминцева А. Е. Геномные исследования для сохранения осетровых: анализ наследования полиплоидных локусов и разработка панели маркеров для идентификации гибридов осетровых и продукции из них // Вестник Российского фонда фундаментальных исследований. 2020. № 2 (106). С. 78-87. https://doi.org/10.22204/2410-46392020-106-02-78-87.
5. Abdul-Muneer P.M. (2014). Application of Microsatellite Markers in Conservation Genetics and Fisheries Management: Recent Advances in Population Structure Analysis and Conservation Strategies // Genetics Research International. Pp.1-11. https://doi.org/10.1155/2014/691759.
6. Lei Y., Zhou Y., Price M. et al. (2021). Genome-wide characterization of microsatellite DNA in fishes: survey and analysis of their abundance and frequency in genome-specific regions// BMC Genomics V. 22. N. 1. https://doi.org/10.1186/s12864-021-07752-6.
7. Tautz D. (1989). Hypervariability of simple sequences as a general source for polymorphic DNA markers// Nucleic Acids Research. V.17. N. 16. Pp. 6463-6471.
8. Chaturvedi A., Mohindra V., Singh R.K., Lal K.K., Punia P et al. (2011). Population genetic structure and phylogeography of cyprinid fish Labeo dero (Hamilton, 1822) inferred from allozyme and microsatellite DNA marker analysis // Mol. Biol. Rep. V. 38. Pp 35133529. https://doi.org/10.1007/s11033-010-0462-y.
9. Liu, X., Luo, W., Zeng, C., Wang, W. and Gao, Z. (2011). Isolation of New 40 Microsatellite Markers in Mandarin Fish (Siniperca chuatsi) // International journal of molecular sciences. V.12. N. 7. Pp. 41804189. https://doi.org/10.3390/ijms12074180.
10. Dobrovolskaya O.B., Pont C., Orlov Y.L. et al. (2015). Development of new SSR markers for homoeologous WFZP gene loci based on the study of the structure and location of microsatellites in gene-rich regions of chromosomes 2AS, 2BS, and 2DS in bread wheat // Vavilov Journal of Genetics and Breeding. V. 19. N. 3. Pp. 330–337. DOI:10.18699/VJ15.039.
11. Weber JL. (1990) Informativeness of human (dC-dA)n * (dG-dT)n polymorphisms // Genomics. V.7. N. 4. Pp. 524-30. https://doi.org/10.1016/08887543(90)90195-z.
12. Crooijmans R. P. M. A., Van der Poel J. J., Groenen M. A. M., Bierbooms V. A. F., Komen J. (1997) Microsatellite markers in common carp (Cyprinus carpio L.) // Animal Genetics. V. 28. N. 2. Pp. 129-134. https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.1997.00097.x.
13. Лемеш В.А., Агеец В.Ю., Царь А.И. [и др.] Оценка генетического разнообразия и структуры зарубежных пород карпа (Cyprinus carpio L.), выращиваемых в аквакультуре в Беларуси // Молекулярная и прикладная генетика. 2023. Т 35. С. 45-51.
14. Peakall R., Smouse P. E. (2012) GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research-an update // Bioinformatics. V. 28. N. 19. Pp. 2537-2539. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bts460.
15. Pritchard J. K., Stephens M., Donnelly P. (2000) Inference of Population Structure Using Multilocus Genotype Data // Genetics. V. 155. N. 2. Pp. 945-959. https://doi.org/10.1093/genetics/155.2.945.
Рецензия
Для цитирования:
Морузи И.В., Елисеева Е.А., Разоков Н.Н., Михайлова М.С. Оценка генетического разнообразия внутрипородного типа породы Сарбоянский карп Cyprinus carpio L. Рыбное хозяйство. 2025;1(1):110-115. https://doi.org/10.36038/0131-6184-2025-1-110-115. EDN: RREMYT
For citation:
Moruzi I.V., Eliseeva E.A., Razokov N.N., Mikhailova M.S. Assessment of the genetic diversity of the intra-breed type of the Sarboyan carp Cyprinus carpio L. Fisheries. 2025;1(1):110-115. (In Russ.) https://doi.org/10.36038/0131-6184-2025-1-110-115. EDN: RREMYT
Просмотров:
38
Послать статью по эл. почте 