Обнаружение особо опасных вирусных болезней рыб семейства лососёвых (Salmo salar) с применением полимеразной цепной реакции

Значительный экономический ущерб объектам аквакультуры и морским гидробионтам наносят вирусные болезни рыб, почти четверть из выявленных вирусов вызывают заболевания. Возбудители болезней в основном попадают при перевозках инфицированных рыб из неблагополучных хозяйств в «чистые» аквафермы, а также от «сбежавшей» из садков рыбы в море, где происходит контаминация природного лосося и других гидробионтов. При доставке рыбопосадочного материала в Россию из стран с различной эпизоотологической ситуацией необходим постоянный мониторинг и прогнозирование возможных рисков. Для предотвращения распространения вирусных инфекций рыб ведущее место занимают диагностика и профилактика. Лабораторная диагностика болезней рыб вирусной этиологии основана на выделении возбудителя и его идентификации серологическими методами, требующими продолжительного времени и выполнения исследований в профильных специализированных лабораториях крупных НИИ. Более эффективными и высокочувствительными являются молекулярные методы диагностики, в частности, полимеразная цепная реакция (ПЦР) с обратной транскрипцией по выявлению ряда особо опасных вирусных болезней рыб. Высокоспецифичным и чувствительным диагностическим методом ПЦР были идентифицированы инфекционный некроз гемопоэтической ткани, инфекционный панкреатический некроз, вирусная геморрагическая септицемия и инфекционная анемия лососёвых. Усовершенствованная методика проведения ПЦР с обратной транскрипцией позволяет обнаружить возбудителей болезней у лососёвых и других рыб как с явными клиническими признаками, так и со скрытым вирусоносительством.

1. Болезни рыб в аквакультуре России. Практическое руководство / Воронин В.Н., Кузнецова Е.В., Стрелков Ю.А., Чернышёва Н.Б. – С.-Пб.: ФГНУ «ГосНИОРХ», 2011. – 264 с.

2. Доронин М.И., Котова Е.В., Никитин М.М. Мудрак Н.С. Одновременная идентификация вирусов лососевых рыб с помощью метода обратной транскрипции и полимеразной цепной реакции в режиме реального времени (ОТ-ПЦР-РВ) в формате микрочипов // Сборник трудов IX Всероссийской научно-практической конференции с международным участием: Молекулярная диагностика. – Москва, 2017. Том 2. – С. 367-368.

3. Жигалева О.Н. Выявление РНК возбудителя вирусной геморрагической септицемии рыб методом ПЦР / О.Н. Жигалева, О.Л. Колбасова, С.Ж. Цыбанов, Н.В. Колбасов // Ветеринария. – 2006. – №9. – С. 24-26

4. Завьялова Е.А. Индикация и идентификация некоторых особо опасных вирусов рыб методом ПЦР / Е.А. Завьялова, Н.Ю. Кандрина, Н.Ф. Ломакина, М.И. Гулюкин // Рыбоводство и рыбное хозяйство. – 2015. – № 3 – С. 21-25.

5. Здоровая рыба. Профилактика, диагностика и лечение болезни / Риитта Рахконен, Пиа Веннерстрем, Пяйви Ринтамяки, Ристо Каннел. – 2-е изд., перераб. и доп. – Хельсинки.: НИИ охотничьего и рыбного хозяйства Финляндии, 2013. – 177 с.

6. Павлов Д.К. Анализ эпизоотической ситуации в мире по вирусным болезням рыб / Д.К. Павлов, А.А. Пичуева // Ветеринария сегодня. – 2015. – №2 (13). – С. 54-58.

7. Попова А.Г. Методы идентификации и типирования вируса инфекционного некроза гемопоэтической ткани лососевых рыб на основе ОТ-ПЦР / А.Г. Попова, С.Ф. Орешкова, И.С. Щелкунов и др. // Вопросы вирусологии. – 2008. – № 3. – С. 39-43.

8. Способ диагностики вируса инфекционного некроза поджелудочной железы лососевых методом полимеразной цепной реакции. Патент РФ № RU 2508547 C2. Бюл. 2014. № 6. Н.Ю. Кандрина, Н.Ф. Ломакина, Е.А. Завьялова, М.И. Гулякин.

9. Devold M., Krossoy B., Aspehaug V. et al. Use of RT-PCR for diagnosis of infectious salmon anaemia virus (ISAV) in carrier sea trout Salmo trutta after experimental infection // Dis. Aquat. Org. 2000. Vol. 40. Pp. 9-18

10. Einer-Jensen K., Ahrens P., Lorenzen N. Parallel phylogenetic analyses using the N, G or Nv gene from a fixed group of VHSV isolates reveal the same overall genetic typing // Dis. Aquat. Org. 2005. Vol. 67. – Pp. 39-45.

11. Emmenegger E.J., Meyers T.R., Burton T.O. and Kurath G. Genetic diversity and epidemiology of infectious hematopoietic necrosis virus in Alaska. // Dis. Aquat. Org. 2000. Vol. 40. – Pp. 163-176.

12. Johansson T., Einer-Jensen K., Batts W. et al. Genetic and serological typing of European infectious hematopoietic necrosis virus (IHNV) isolates // Dis. Aquat. Org. 2009. Vol. 86. – Pp. 213-221.

13. Kibenge M., Iwamoto T., Wang Y. et al. Discovery of variant infectious salmon anaemia virus (ISAV) of European genotype in British Columbia, Canada // Virol. J. 2016. 13:3. doi: 10.1186/s12985-015-0459-1.

14. OIE. Manual of Diagnostic Tests for Aquatic Animals. 7th ed. Paris, 2016. – 589 Pp.

15. Rudakova S.L., Kurath G., Bochkova E.V. Occurrence and genetic typing of infectious hematopoietic necrosis virus in Kamchatka, Russia // Dis. Aquat. Org. 2007. Vol. 75. – Pp. 1-11.

16. Tapia D., Eissler Y., Torres P. et al. Detection and phylogenetic analysis of infectious pancreatic necrosis virus in Chile // Dis. Aquat. Org. 2015. Vol.116. Pp. 173-184.

17. Vennerström P., Välimäki E., Hautaniemi M. et al. Wild fish are negligible transmitters of viral haemorrhagic septicaemia virus (VHSV) genotype Id in the VHS restriction zone in Finland // Dis. Aquat. Org. 2018. Vol. 131. – Pp. 187-197