Результаты генетического анализа племенного ядра сарбоянского карпа

В работе дана оценка результатов генетического анализа племенного ядра сарбоянского карпа ООО «Экопарк». Анализ был проведен методом ПЦР диагностики по гену COXI. Выявлены преимущественные гаплотипы племенной группы сарбоянского карпа. Анализ медианной сети гаплотипов показал, что рассматриваемые гаплотипы карпа и дикого сазана формируют две гаплогруппы, связанные через 1 гаплотип. Один из гаплотипов, наиболее многочисленный среди них – H1, в него входит до 78% изученного массива рыб. Стадо рыб, взятых для исследования, было изучено по 8 бонитировочным промерам (массе тела, абсолютной длине тела, длине тела без хвостового плавника, наибольшей высоте, ширине и обхвату). Был проведен сравнительный анализ особенностей телосложения рыб самцов и самок, принадлежащих к различным гаплотипам. Внутри гаплогруппы существует половой диморфизм по морфологическим признакам. Самцы от самок достоверно отличаются по массе, толщине и обхвату тела, а также – по соответствующим индексам телосложения. Вторая, наиболее многочисленная гаплогруппа – H16, входящие в нее самки превосходят самцов по массе тела, толщине и обхвату. Сравнение самцов из разных групп h1 и h16 не выявило различие морфологического признаков, те же закономерности установлены по отношению к экстерьеру самок. Филогенетический анализ, проведенный на основе собственных гаплотипов и взятых из международной базы данных NCBI, подтверждает известные сведения о том, что сарбоянский карп представляет собой глубоко гибридную группировку, созданную на основе вводного скрещивания белорусских карпов и амурского сазана.

1. Gjedrem T, Robinson N, Rye M. (2012) The importance of selective breeding in aquaculture to meet future demands for animal protein: A review. Aquaculture. PP. 350-353: 117-129. doi:10.1016/j.aquaculture.2012.04.008

2. Итоги деятельности федерального агентства по рыболовству в 2021 году. itogi_raboty_rosrybolovstvo_za_2021_god.pdf . (Дата обращения 20 сентября 2023 г.)

3. Ninh NH, Ponzoni RW, Nguyen NH, Woolliams JA, Taggart JB, McAndrew BJ, et al. (2011) A comparison of communal and separate rearing of families in selective breeding of common carp (Cyprinus carpio): Estimation of genetic parameters. Aquaculture, 2011. Pp. 322-323: 39-46. https://hdl.handle.net/20.500.12348/1173

4. Dong Z, Nguyen NH, Zhu W. (2015) Genetic evaluation of a selective breeding program for common carp Cyprinus carpio conducted from 2004 to 2014. BMC Genet. P. 16(94). doi: 10.1186/s12863-015-0256-2.

5. Bauer C., Schlott G. (2004) Overwintering of farmed common carp (Cyprinus carpio L.) in the ponds of a central European aquaculture facility—measurement of activity by radio telemetry. Aquaculture. 241(1-4). Pp. 301-317. doi:10.1016/j.aquacultural.2004.08.010

6. Palaiokostas C., Cariou S., Bestin A., Bruant J. S., Haffray P., Morin T., et al. (2018). Genome-wide association and genomic prediction of resistance to viral nervous necrosis in European sea bass (Dicentrarchus labrax) using RAD sequencing. Genet. Sel. Evol. Pp. 50:30. doi: 10.1186/s12711-018-0401-2’

7. Palaiokostas C., Kocour M., Prchal M., and Houston R.D. (2018). Accuracy of genomic evaluations of juvenile growth rate in common carp (Cyprinus carpio) using genotyping by sequencing. Front. Genet. 9:82. doi: 10.3389/fgene.2018.00082

8. Hulata G. (1995). A review of genetic improvement of the common carp (Cyprinus carpio L.) and other cyprinids by crossbreeding, hybridization and selection. Aquac, 129. P. 481–491.

9. Linhart O. (2008). A proposal and case study towards a conceptual approach of validating sperm competition in common carp (Cyprinus carpio L.), with practical implications for hatchery procedures. J. App. Ichthyol., 24. Pp. 406-409.

10. Vandeputte M. ( 2003). Selective breeding of quantitative traits in the common carp (Cyprinus carpio): a review. Aquat. Living Resour, 16. Pp. 399-407.

11. Wohlfarth G., Moav R., Hulata G. (1975). Genetic differences between Chinese and European races of the common carp. II. Multicharacter variation—a response to the diverse methods of fish cultivation in Europe and China. Hered, 34. Pp. 341-350.

12. Gjerde B. (1988). Complete diallel cross between six inbred groups of rainbow trout, Salmo gairdneri. Aquac.75. Pp.71-87.

13. Brody T., Wohlfarth G., Hulata G., Moav R. (1981). Application of electrophoretic genetic markers to fish breeding. IV. Assesment of breeding value of full-sib families. Aquac, 24. Pp.175-186

14. Vandeputte M., Kocour M., Mauger S., Rodina M., Launay A., Gela D., Dupont-Nivet M., Hulak M., Linhart O. (2008). Genetic variation for growth at one and two summers of age in the common carp (Cyprinus carpio L.): heritability estimates and response to selection. Aquac, 277. Pp. 7-13.

15. Иванова З.А., Морузи И.В., Пищенко Е.В. Алтайский зеркальный карп – новая высокопродуктивная порода прудовых рыб: монография. МСХ РФ. Новосибирск: НГАУ. 2002. 204 с

16. Иоганзен Б.Г. Рост карпа в Западной Сибири. // Информ. бюлл. ВНИОРХ. 1940. №6.

17. Иоганзен Б.Г., Петкевич А.Н. Акклиматизация рыб в Западной Сибири. Барабинск, отд. ВНИОРХ. 1951. Т. 5. 204 с.

18. Иванова З.А. Карп Западной Сибири. М.: Пищевая промышленность.1983. 113 с.

19. Иванова 3.А., Морузи И.В. Сообщение 1. Рыбоводно-биологическая характеристика алтайского зеркального карпа // Сиб. вестн. с.-х. науки. 1996. №3-4.

20. Морузи И.В., Иванова З.А., Жданова Н.И., Сапунов Л.Я., Буймов В.И. Селекционное достижение в животноводстве: новая порода прудовых рыб – алтайский зеркальный карп. Авторское свидетельство № 6135, по заявке № 269/82 от 7.05. 1992. Зарегистрирована в гос. реестре Роспатента 23.03.94.

21. Морузи И.В. Система создания и продуктивные качества алтайского зеркального карпа. Новосибирск. 1995. 66 с.

22. Hall T.A. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT // Nucl. Ac. Symp. Ser. V. 41 Pp. 95-98.

23. Librado P., Rozas J. (2009). DnaSP v5: A software for comprehensive analysis of DNA polymorphism data // Bioinformatics. V. 25 Pp. 1451-1452.

24. Tamura K., Stecher G., Peterson D., Filipski A., Kumar S. (2013). MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0. Mol Biol Evol. Dec. 30(12). 2725-9. DOI: 10.1093/molbev/mst197.

25. Правдин И. Ф. Руководство по изучению рыб. М.: Пищ. пром-сть. 1966. 376 с.

26. Морузи И.В., Законнова Л.И., Пищенко Е.В., Осинцева Л.А., Кропачев Д.В., Барсукова М.А., Селюков А.Г. Эффективность племенной работы со стадами карпа на юге Западной Сибири. // Рыбное хозяйство. 2019. № 1. С. 71-76.

27. Плохинский Н.А. Руководство по биометрии для зоотехников М.: Колос, 1969. 256 с.